针对员工恶意投诉公司是否违法的问题，您可以向劳动保障行政部门反映情况。根据《劳动争议调解仲裁法》，劳动者确实有投诉的权利，但若是恶意投诉，您应当提供相关证据来证明。此类行为若不及时处理，可能会损害公司声誉和正常运营。
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对员工的恶意投诉，公司可以采取法律手段应对。一方面，可以要求员工进行赔偿以弥补公司所遭受的损失；另一方面，如果情况严重，还可以选择报警处理。对于是否违法以及如何处理，双方可以通过协商或者法律途径来解决。
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员工恶意投诉公司是否违法，可以通过法律途径进行确认。如果员工的投诉行为导致了公司的经济损失，可以根据劳动合同要求赔偿。如果其行为涉嫌犯罪，建议及时报警并提交相关证据，公安机关会依法展开调查并追究其相应的法律责任。